Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2CP19387 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2CP19387 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2CP19387 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2CP19387 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2CP19387 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2CP19387 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2CP19387 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2CP19387 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2CP19387 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2CP19387 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2CP19387 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2CP19387 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2CP19387 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2CP19387 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2CP19387 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2CP19387 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2CP19387 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2CP19387 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2CP19387 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2CP19387 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2CP19387 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2CP19387 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2CP19387 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2CP19387 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2CP19387 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2CP19387 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2CP19387 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2CP19387 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2CP19387 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2CP19387 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2CP19387 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2CP19387 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2CP19387 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2CP19387 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2CP19387 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2CP19387 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2CP19387 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2CP19387 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2CP19387 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2CP19387 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2CP19387 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2CP19387 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2CP19387 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms