Protein–RNA interactions for Protein: P17538

CTRB1, Chymotrypsinogen B, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRB1P17538 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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