Protein–RNA interactions for Protein: P13765

HLA-DOB, HLA class II histocompatibility antigen, DO beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOBP13765 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms