Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BMP3P12645 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BMP3P12645 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BMP3P12645 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BMP3P12645 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BMP3P12645 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BMP3P12645 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BMP3P12645 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BMP3P12645 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BMP3P12645 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BMP3P12645 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BMP3P12645 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BMP3P12645 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BMP3P12645 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
BMP3P12645 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BMP3P12645 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BMP3P12645 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BMP3P12645 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
BMP3P12645 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
BMP3P12645 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
BMP3P12645 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
BMP3P12645 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
BMP3P12645 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BMP3P12645 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BMP3P12645 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BMP3P12645 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BMP3P12645 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BMP3P12645 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BMP3P12645 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BMP3P12645 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BMP3P12645 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BMP3P12645 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
BMP3P12645 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
BMP3P12645 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BMP3P12645 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
BMP3P12645 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BMP3P12645 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BMP3P12645 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BMP3P12645 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BMP3P12645 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BMP3P12645 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BMP3P12645 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BMP3P12645 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
BMP3P12645 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BMP3P12645 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BMP3P12645 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BMP3P12645 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BMP3P12645 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BMP3P12645 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BMP3P12645 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BMP3P12645 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
BMP3P12645 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BMP3P12645 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
BMP3P12645 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BMP3P12645 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BMP3P12645 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BMP3P12645 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BMP3P12645 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BMP3P12645 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BMP3P12645 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BMP3P12645 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BMP3P12645 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BMP3P12645 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BMP3P12645 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BMP3P12645 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BMP3P12645 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BMP3P12645 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BMP3P12645 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BMP3P12645 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BMP3P12645 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BMP3P12645 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BMP3P12645 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BMP3P12645 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BMP3P12645 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BMP3P12645 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BMP3P12645 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BMP3P12645 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BMP3P12645 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BMP3P12645 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BMP3P12645 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BMP3P12645 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BMP3P12645 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BMP3P12645 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BMP3P12645 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BMP3P12645 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BMP3P12645 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BMP3P12645 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BMP3P12645 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BMP3P12645 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BMP3P12645 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
BMP3P12645 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BMP3P12645 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BMP3P12645 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BMP3P12645 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BMP3P12645 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BMP3P12645 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BMP3P12645 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BMP3P12645 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BMP3P12645 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BMP3P12645 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms