Protein–RNA interactions for Protein: P11586

MTHFD1, C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFD1P11586 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MTHFD1P11586 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MTHFD1P11586 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MTHFD1P11586 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MTHFD1P11586 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MTHFD1P11586 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MTHFD1P11586 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MTHFD1P11586 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MTHFD1P11586 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MTHFD1P11586 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MTHFD1P11586 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MTHFD1P11586 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MTHFD1P11586 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MTHFD1P11586 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MTHFD1P11586 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MTHFD1P11586 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MTHFD1P11586 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MTHFD1P11586 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MTHFD1P11586 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MTHFD1P11586 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
MTHFD1P11586 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MTHFD1P11586 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
MTHFD1P11586 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MTHFD1P11586 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
MTHFD1P11586 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MTHFD1P11586 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MTHFD1P11586 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MTHFD1P11586 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MTHFD1P11586 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MTHFD1P11586 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MTHFD1P11586 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MTHFD1P11586 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MTHFD1P11586 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MTHFD1P11586 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MTHFD1P11586 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MTHFD1P11586 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MTHFD1P11586 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MTHFD1P11586 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MTHFD1P11586 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MTHFD1P11586 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MTHFD1P11586 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MTHFD1P11586 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MTHFD1P11586 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MTHFD1P11586 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MTHFD1P11586 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MTHFD1P11586 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MTHFD1P11586 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MTHFD1P11586 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MTHFD1P11586 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MTHFD1P11586 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MTHFD1P11586 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MTHFD1P11586 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
MTHFD1P11586 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MTHFD1P11586 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MTHFD1P11586 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MTHFD1P11586 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MTHFD1P11586 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MTHFD1P11586 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MTHFD1P11586 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
MTHFD1P11586 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MTHFD1P11586 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MTHFD1P11586 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MTHFD1P11586 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MTHFD1P11586 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MTHFD1P11586 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MTHFD1P11586 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MTHFD1P11586 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MTHFD1P11586 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MTHFD1P11586 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MTHFD1P11586 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MTHFD1P11586 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
MTHFD1P11586 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MTHFD1P11586 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MTHFD1P11586 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MTHFD1P11586 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MTHFD1P11586 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MTHFD1P11586 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
MTHFD1P11586 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MTHFD1P11586 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MTHFD1P11586 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MTHFD1P11586 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MTHFD1P11586 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MTHFD1P11586 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MTHFD1P11586 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MTHFD1P11586 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MTHFD1P11586 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MTHFD1P11586 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MTHFD1P11586 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MTHFD1P11586 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MTHFD1P11586 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MTHFD1P11586 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MTHFD1P11586 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MTHFD1P11586 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MTHFD1P11586 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MTHFD1P11586 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MTHFD1P11586 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MTHFD1P11586 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MTHFD1P11586 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MTHFD1P11586 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MTHFD1P11586 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms