Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGAMP11215 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms