Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms