Protein–RNA interactions for Protein: P08174

CD55, Complement decay-accelerating factor, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD55P08174 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD55P08174 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD55P08174 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CD55P08174 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD55P08174 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD55P08174 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD55P08174 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD55P08174 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD55P08174 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD55P08174 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD55P08174 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD55P08174 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD55P08174 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD55P08174 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD55P08174 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD55P08174 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD55P08174 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD55P08174 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD55P08174 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD55P08174 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD55P08174 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD55P08174 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD55P08174 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD55P08174 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD55P08174 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD55P08174 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD55P08174 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CD55P08174 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD55P08174 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD55P08174 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD55P08174 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD55P08174 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD55P08174 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD55P08174 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD55P08174 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD55P08174 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CD55P08174 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD55P08174 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD55P08174 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD55P08174 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD55P08174 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD55P08174 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD55P08174 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD55P08174 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD55P08174 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD55P08174 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD55P08174 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD55P08174 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD55P08174 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD55P08174 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CD55P08174 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD55P08174 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD55P08174 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD55P08174 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD55P08174 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD55P08174 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD55P08174 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD55P08174 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD55P08174 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD55P08174 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD55P08174 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD55P08174 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD55P08174 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD55P08174 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD55P08174 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD55P08174 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD55P08174 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD55P08174 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD55P08174 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD55P08174 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD55P08174 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD55P08174 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD55P08174 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD55P08174 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD55P08174 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD55P08174 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD55P08174 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD55P08174 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD55P08174 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD55P08174 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD55P08174 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD55P08174 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD55P08174 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD55P08174 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD55P08174 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD55P08174 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD55P08174 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD55P08174 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD55P08174 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD55P08174 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD55P08174 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD55P08174 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD55P08174 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD55P08174 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD55P08174 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CD55P08174 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CD55P08174 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CD55P08174 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD55P08174 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD55P08174 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms