Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NEFMP07197 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEFMP07197 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEFMP07197 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEFMP07197 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEFMP07197 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEFMP07197 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEFMP07197 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEFMP07197 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEFMP07197 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEFMP07197 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEFMP07197 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEFMP07197 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEFMP07197 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEFMP07197 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEFMP07197 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEFMP07197 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEFMP07197 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEFMP07197 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEFMP07197 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEFMP07197 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEFMP07197 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEFMP07197 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEFMP07197 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEFMP07197 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEFMP07197 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEFMP07197 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEFMP07197 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEFMP07197 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEFMP07197 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEFMP07197 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEFMP07197 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEFMP07197 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEFMP07197 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEFMP07197 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEFMP07197 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEFMP07197 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEFMP07197 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEFMP07197 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEFMP07197 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEFMP07197 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEFMP07197 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEFMP07197 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEFMP07197 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEFMP07197 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEFMP07197 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEFMP07197 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEFMP07197 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEFMP07197 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEFMP07197 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEFMP07197 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEFMP07197 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEFMP07197 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEFMP07197 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEFMP07197 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEFMP07197 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEFMP07197 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEFMP07197 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEFMP07197 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEFMP07197 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEFMP07197 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NEFMP07197 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NEFMP07197 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NEFMP07197 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NEFMP07197 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEFMP07197 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEFMP07197 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEFMP07197 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEFMP07197 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEFMP07197 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NEFMP07197 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NEFMP07197 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEFMP07197 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEFMP07197 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEFMP07197 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEFMP07197 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEFMP07197 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEFMP07197 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEFMP07197 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEFMP07197 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEFMP07197 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEFMP07197 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEFMP07197 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEFMP07197 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEFMP07197 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEFMP07197 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEFMP07197 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEFMP07197 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEFMP07197 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEFMP07197 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEFMP07197 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NEFMP07197 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEFMP07197 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEFMP07197 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEFMP07197 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEFMP07197 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NEFMP07197 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEFMP07197 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEFMP07197 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEFMP07197 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms