Protein–RNA interactions for Protein: O95503

CBX6, Chromobox protein homolog 6, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX6O95503 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CBX6O95503 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CBX6O95503 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CBX6O95503 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CBX6O95503 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CBX6O95503 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBX6O95503 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBX6O95503 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBX6O95503 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBX6O95503 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CBX6O95503 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBX6O95503 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBX6O95503 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CBX6O95503 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBX6O95503 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBX6O95503 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBX6O95503 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBX6O95503 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBX6O95503 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBX6O95503 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBX6O95503 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBX6O95503 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CBX6O95503 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBX6O95503 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBX6O95503 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBX6O95503 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBX6O95503 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBX6O95503 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBX6O95503 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBX6O95503 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CBX6O95503 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CBX6O95503 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CBX6O95503 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CBX6O95503 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CBX6O95503 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CBX6O95503 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CBX6O95503 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CBX6O95503 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CBX6O95503 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CBX6O95503 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CBX6O95503 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CBX6O95503 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CBX6O95503 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CBX6O95503 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CBX6O95503 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CBX6O95503 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CBX6O95503 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CBX6O95503 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CBX6O95503 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CBX6O95503 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CBX6O95503 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CBX6O95503 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CBX6O95503 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBX6O95503 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBX6O95503 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBX6O95503 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBX6O95503 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBX6O95503 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBX6O95503 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBX6O95503 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBX6O95503 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CBX6O95503 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBX6O95503 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBX6O95503 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CBX6O95503 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBX6O95503 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBX6O95503 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBX6O95503 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBX6O95503 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBX6O95503 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBX6O95503 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBX6O95503 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBX6O95503 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBX6O95503 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBX6O95503 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBX6O95503 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBX6O95503 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBX6O95503 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CBX6O95503 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBX6O95503 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBX6O95503 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBX6O95503 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBX6O95503 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBX6O95503 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBX6O95503 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBX6O95503 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBX6O95503 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBX6O95503 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CBX6O95503 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CBX6O95503 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CBX6O95503 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CBX6O95503 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CBX6O95503 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CBX6O95503 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CBX6O95503 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CBX6O95503 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CBX6O95503 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CBX6O95503 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CBX6O95503 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CBX6O95503 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms