Protein–RNA interactions for Protein: O95076

ALX3, Homeobox protein aristaless-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX3O95076 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALX3O95076 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALX3O95076 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALX3O95076 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALX3O95076 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALX3O95076 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ALX3O95076 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALX3O95076 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALX3O95076 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALX3O95076 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALX3O95076 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALX3O95076 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALX3O95076 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALX3O95076 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ALX3O95076 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALX3O95076 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALX3O95076 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALX3O95076 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALX3O95076 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALX3O95076 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALX3O95076 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ALX3O95076 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALX3O95076 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALX3O95076 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALX3O95076 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALX3O95076 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ALX3O95076 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALX3O95076 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALX3O95076 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALX3O95076 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALX3O95076 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALX3O95076 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALX3O95076 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALX3O95076 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ALX3O95076 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALX3O95076 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALX3O95076 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALX3O95076 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALX3O95076 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALX3O95076 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALX3O95076 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALX3O95076 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALX3O95076 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALX3O95076 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALX3O95076 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALX3O95076 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALX3O95076 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ALX3O95076 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALX3O95076 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ALX3O95076 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ALX3O95076 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ALX3O95076 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ALX3O95076 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
ALX3O95076 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ALX3O95076 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ALX3O95076 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ALX3O95076 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALX3O95076 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALX3O95076 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALX3O95076 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALX3O95076 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALX3O95076 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALX3O95076 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALX3O95076 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALX3O95076 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALX3O95076 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALX3O95076 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALX3O95076 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALX3O95076 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALX3O95076 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALX3O95076 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALX3O95076 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALX3O95076 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALX3O95076 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALX3O95076 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALX3O95076 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALX3O95076 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALX3O95076 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALX3O95076 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALX3O95076 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ALX3O95076 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALX3O95076 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ALX3O95076 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALX3O95076 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ALX3O95076 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALX3O95076 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALX3O95076 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALX3O95076 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALX3O95076 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALX3O95076 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALX3O95076 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ALX3O95076 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALX3O95076 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALX3O95076 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALX3O95076 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALX3O95076 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALX3O95076 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALX3O95076 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALX3O95076 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALX3O95076 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms