Protein–RNA interactions for Protein: O75400

PRPF40A, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 957 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40AO75400 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PRPF40AO75400 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PRPF40AO75400 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRPF40AO75400 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRPF40AO75400 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRPF40AO75400 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRPF40AO75400 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRPF40AO75400 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRPF40AO75400 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRPF40AO75400 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
PRPF40AO75400 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRPF40AO75400 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PRPF40AO75400 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PRPF40AO75400 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRPF40AO75400 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRPF40AO75400 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRPF40AO75400 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PRPF40AO75400 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PRPF40AO75400 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRPF40AO75400 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PRPF40AO75400 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PRPF40AO75400 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRPF40AO75400 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PRPF40AO75400 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PRPF40AO75400 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PRPF40AO75400 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PRPF40AO75400 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRPF40AO75400 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PRPF40AO75400 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRPF40AO75400 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRPF40AO75400 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRPF40AO75400 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PRPF40AO75400 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRPF40AO75400 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRPF40AO75400 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRPF40AO75400 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRPF40AO75400 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PRPF40AO75400 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRPF40AO75400 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PRPF40AO75400 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRPF40AO75400 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRPF40AO75400 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRPF40AO75400 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRPF40AO75400 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PRPF40AO75400 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRPF40AO75400 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRPF40AO75400 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRPF40AO75400 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRPF40AO75400 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRPF40AO75400 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRPF40AO75400 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRPF40AO75400 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PRPF40AO75400 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRPF40AO75400 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRPF40AO75400 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PRPF40AO75400 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRPF40AO75400 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRPF40AO75400 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRPF40AO75400 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRPF40AO75400 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PRPF40AO75400 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PRPF40AO75400 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRPF40AO75400 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PRPF40AO75400 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRPF40AO75400 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PRPF40AO75400 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PRPF40AO75400 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PRPF40AO75400 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PRPF40AO75400 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRPF40AO75400 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PRPF40AO75400 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRPF40AO75400 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRPF40AO75400 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRPF40AO75400 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRPF40AO75400 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PRPF40AO75400 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRPF40AO75400 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRPF40AO75400 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRPF40AO75400 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PRPF40AO75400 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PRPF40AO75400 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PRPF40AO75400 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PRPF40AO75400 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRPF40AO75400 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PRPF40AO75400 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRPF40AO75400 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRPF40AO75400 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRPF40AO75400 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRPF40AO75400 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PRPF40AO75400 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRPF40AO75400 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRPF40AO75400 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRPF40AO75400 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRPF40AO75400 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PRPF40AO75400 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRPF40AO75400 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRPF40AO75400 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRPF40AO75400 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PRPF40AO75400 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRPF40AO75400 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
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