Protein–RNA interactions for Protein: O75379

VAMP4, Vesicle-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4O75379 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VAMP4O75379 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms