Protein–RNA interactions for Protein: O60443

DFNA5, Non-syndromic hearing impairment protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFNA5O60443 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DFNA5O60443 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DFNA5O60443 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DFNA5O60443 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DFNA5O60443 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DFNA5O60443 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DFNA5O60443 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DFNA5O60443 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DFNA5O60443 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DFNA5O60443 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DFNA5O60443 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DFNA5O60443 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DFNA5O60443 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DFNA5O60443 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DFNA5O60443 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DFNA5O60443 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DFNA5O60443 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DFNA5O60443 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DFNA5O60443 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DFNA5O60443 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
DFNA5O60443 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DFNA5O60443 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DFNA5O60443 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DFNA5O60443 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DFNA5O60443 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DFNA5O60443 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DFNA5O60443 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DFNA5O60443 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DFNA5O60443 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DFNA5O60443 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
DFNA5O60443 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
DFNA5O60443 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DFNA5O60443 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
DFNA5O60443 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DFNA5O60443 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DFNA5O60443 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DFNA5O60443 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DFNA5O60443 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DFNA5O60443 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DFNA5O60443 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DFNA5O60443 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DFNA5O60443 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DFNA5O60443 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DFNA5O60443 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DFNA5O60443 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DFNA5O60443 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DFNA5O60443 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DFNA5O60443 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DFNA5O60443 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DFNA5O60443 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DFNA5O60443 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DFNA5O60443 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DFNA5O60443 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DFNA5O60443 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DFNA5O60443 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DFNA5O60443 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DFNA5O60443 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DFNA5O60443 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DFNA5O60443 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DFNA5O60443 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
DFNA5O60443 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DFNA5O60443 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
DFNA5O60443 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DFNA5O60443 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DFNA5O60443 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
DFNA5O60443 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DFNA5O60443 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DFNA5O60443 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DFNA5O60443 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DFNA5O60443 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DFNA5O60443 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DFNA5O60443 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DFNA5O60443 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DFNA5O60443 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DFNA5O60443 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DFNA5O60443 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DFNA5O60443 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DFNA5O60443 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DFNA5O60443 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DFNA5O60443 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DFNA5O60443 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DFNA5O60443 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DFNA5O60443 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DFNA5O60443 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DFNA5O60443 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DFNA5O60443 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DFNA5O60443 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DFNA5O60443 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DFNA5O60443 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DFNA5O60443 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DFNA5O60443 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DFNA5O60443 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DFNA5O60443 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DFNA5O60443 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DFNA5O60443 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DFNA5O60443 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
DFNA5O60443 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
DFNA5O60443 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DFNA5O60443 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DFNA5O60443 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms