Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms