Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYNGR3O43761 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms