Protein–RNA interactions for Protein: O43581

SYT7, Synaptotagmin-7, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT7O43581 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYT7O43581 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYT7O43581 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYT7O43581 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYT7O43581 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYT7O43581 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYT7O43581 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYT7O43581 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYT7O43581 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYT7O43581 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYT7O43581 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYT7O43581 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYT7O43581 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYT7O43581 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYT7O43581 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYT7O43581 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYT7O43581 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYT7O43581 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYT7O43581 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYT7O43581 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYT7O43581 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYT7O43581 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYT7O43581 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYT7O43581 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYT7O43581 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYT7O43581 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYT7O43581 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SYT7O43581 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYT7O43581 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYT7O43581 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYT7O43581 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT7O43581 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT7O43581 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT7O43581 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT7O43581 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT7O43581 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT7O43581 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT7O43581 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT7O43581 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT7O43581 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT7O43581 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT7O43581 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT7O43581 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT7O43581 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT7O43581 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT7O43581 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT7O43581 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT7O43581 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT7O43581 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT7O43581 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT7O43581 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT7O43581 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT7O43581 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT7O43581 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT7O43581 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT7O43581 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT7O43581 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT7O43581 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT7O43581 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT7O43581 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT7O43581 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT7O43581 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT7O43581 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT7O43581 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT7O43581 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT7O43581 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT7O43581 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT7O43581 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT7O43581 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT7O43581 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT7O43581 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT7O43581 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT7O43581 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT7O43581 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT7O43581 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT7O43581 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT7O43581 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT7O43581 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT7O43581 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT7O43581 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT7O43581 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT7O43581 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT7O43581 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT7O43581 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT7O43581 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT7O43581 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT7O43581 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT7O43581 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT7O43581 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT7O43581 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT7O43581 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT7O43581 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT7O43581 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT7O43581 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT7O43581 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT7O43581 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT7O43581 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT7O43581 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT7O43581 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SYT7O43581 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms