Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms