Protein–RNA interactions for Protein: O14936

CASK, Peripheral plasma membrane protein CASK, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKO14936 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CASKO14936 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CASKO14936 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CASKO14936 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CASKO14936 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CASKO14936 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CASKO14936 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CASKO14936 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CASKO14936 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CASKO14936 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CASKO14936 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CASKO14936 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CASKO14936 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CASKO14936 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CASKO14936 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CASKO14936 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CASKO14936 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CASKO14936 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CASKO14936 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CASKO14936 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CASKO14936 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CASKO14936 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CASKO14936 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CASKO14936 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CASKO14936 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CASKO14936 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CASKO14936 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CASKO14936 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CASKO14936 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CASKO14936 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CASKO14936 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CASKO14936 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CASKO14936 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CASKO14936 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CASKO14936 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CASKO14936 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CASKO14936 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CASKO14936 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CASKO14936 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CASKO14936 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CASKO14936 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CASKO14936 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CASKO14936 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CASKO14936 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CASKO14936 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CASKO14936 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CASKO14936 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CASKO14936 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CASKO14936 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CASKO14936 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CASKO14936 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CASKO14936 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CASKO14936 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CASKO14936 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CASKO14936 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CASKO14936 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CASKO14936 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CASKO14936 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CASKO14936 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CASKO14936 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CASKO14936 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CASKO14936 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CASKO14936 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASKO14936 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASKO14936 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASKO14936 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASKO14936 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASKO14936 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASKO14936 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASKO14936 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASKO14936 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASKO14936 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASKO14936 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASKO14936 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASKO14936 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASKO14936 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASKO14936 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASKO14936 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASKO14936 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASKO14936 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASKO14936 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CASKO14936 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASKO14936 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASKO14936 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASKO14936 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASKO14936 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASKO14936 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASKO14936 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASKO14936 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASKO14936 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASKO14936 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASKO14936 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASKO14936 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASKO14936 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASKO14936 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASKO14936 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASKO14936 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASKO14936 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASKO14936 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASKO14936 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.8 ms