Protein–RNA interactions for Protein: O00461

GOLIM4, Golgi integral membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLIM4O00461 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GOLIM4O00461 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GOLIM4O00461 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLIM4O00461 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms