Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms