Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
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