Protein–RNA interactions for Protein: B3KS81

SRRM5, Serine/arginine repetitive matrix protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM5B3KS81 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms