Protein–RNA interactions for Protein: A6NDU8

C5orf51, UPF0600 protein C5orf51, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf51A6NDU8 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C5orf51A6NDU8 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C5orf51A6NDU8 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C5orf51A6NDU8 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C5orf51A6NDU8 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C5orf51A6NDU8 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C5orf51A6NDU8 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C5orf51A6NDU8 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C5orf51A6NDU8 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C5orf51A6NDU8 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
C5orf51A6NDU8 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
C5orf51A6NDU8 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C5orf51A6NDU8 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C5orf51A6NDU8 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C5orf51A6NDU8 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
C5orf51A6NDU8 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C5orf51A6NDU8 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C5orf51A6NDU8 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C5orf51A6NDU8 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
C5orf51A6NDU8 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C5orf51A6NDU8 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C5orf51A6NDU8 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
C5orf51A6NDU8 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C5orf51A6NDU8 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C5orf51A6NDU8 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C5orf51A6NDU8 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C5orf51A6NDU8 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C5orf51A6NDU8 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C5orf51A6NDU8 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C5orf51A6NDU8 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
C5orf51A6NDU8 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C5orf51A6NDU8 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C5orf51A6NDU8 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C5orf51A6NDU8 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C5orf51A6NDU8 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C5orf51A6NDU8 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C5orf51A6NDU8 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C5orf51A6NDU8 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C5orf51A6NDU8 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C5orf51A6NDU8 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C5orf51A6NDU8 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C5orf51A6NDU8 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C5orf51A6NDU8 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C5orf51A6NDU8 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C5orf51A6NDU8 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C5orf51A6NDU8 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C5orf51A6NDU8 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C5orf51A6NDU8 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C5orf51A6NDU8 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C5orf51A6NDU8 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C5orf51A6NDU8 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C5orf51A6NDU8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C5orf51A6NDU8 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C5orf51A6NDU8 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C5orf51A6NDU8 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C5orf51A6NDU8 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C5orf51A6NDU8 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C5orf51A6NDU8 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C5orf51A6NDU8 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C5orf51A6NDU8 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C5orf51A6NDU8 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C5orf51A6NDU8 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C5orf51A6NDU8 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C5orf51A6NDU8 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C5orf51A6NDU8 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C5orf51A6NDU8 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
C5orf51A6NDU8 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C5orf51A6NDU8 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C5orf51A6NDU8 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C5orf51A6NDU8 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C5orf51A6NDU8 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C5orf51A6NDU8 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C5orf51A6NDU8 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C5orf51A6NDU8 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C5orf51A6NDU8 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C5orf51A6NDU8 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C5orf51A6NDU8 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C5orf51A6NDU8 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C5orf51A6NDU8 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C5orf51A6NDU8 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms