Protein–RNA interactions for Protein: A6NCN2

KRT87P, Putative keratin-87 protein, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT87PA6NCN2 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT87PA6NCN2 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT87PA6NCN2 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms