Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms