Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F1

PARP3, Poly [ADP-ribose] polymerase 3, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP3Q9Y6F1 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PARP3Q9Y6F1 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PARP3Q9Y6F1 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PARP3Q9Y6F1 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PARP3Q9Y6F1 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PARP3Q9Y6F1 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PARP3Q9Y6F1 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PARP3Q9Y6F1 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PARP3Q9Y6F1 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PARP3Q9Y6F1 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PARP3Q9Y6F1 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PARP3Q9Y6F1 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PARP3Q9Y6F1 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PARP3Q9Y6F1 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PARP3Q9Y6F1 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PARP3Q9Y6F1 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PARP3Q9Y6F1 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PARP3Q9Y6F1 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PARP3Q9Y6F1 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PARP3Q9Y6F1 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PARP3Q9Y6F1 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PARP3Q9Y6F1 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PARP3Q9Y6F1 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PARP3Q9Y6F1 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PARP3Q9Y6F1 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PARP3Q9Y6F1 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PARP3Q9Y6F1 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PARP3Q9Y6F1 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PARP3Q9Y6F1 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PARP3Q9Y6F1 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PARP3Q9Y6F1 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PARP3Q9Y6F1 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PARP3Q9Y6F1 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PARP3Q9Y6F1 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PARP3Q9Y6F1 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PARP3Q9Y6F1 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PARP3Q9Y6F1 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PARP3Q9Y6F1 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PARP3Q9Y6F1 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PARP3Q9Y6F1 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PARP3Q9Y6F1 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PARP3Q9Y6F1 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PARP3Q9Y6F1 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PARP3Q9Y6F1 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PARP3Q9Y6F1 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PARP3Q9Y6F1 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PARP3Q9Y6F1 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PARP3Q9Y6F1 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PARP3Q9Y6F1 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PARP3Q9Y6F1 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PARP3Q9Y6F1 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PARP3Q9Y6F1 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PARP3Q9Y6F1 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PARP3Q9Y6F1 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PARP3Q9Y6F1 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PARP3Q9Y6F1 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PARP3Q9Y6F1 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PARP3Q9Y6F1 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PARP3Q9Y6F1 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PARP3Q9Y6F1 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PARP3Q9Y6F1 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PARP3Q9Y6F1 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PARP3Q9Y6F1 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PARP3Q9Y6F1 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PARP3Q9Y6F1 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PARP3Q9Y6F1 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PARP3Q9Y6F1 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PARP3Q9Y6F1 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PARP3Q9Y6F1 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PARP3Q9Y6F1 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PARP3Q9Y6F1 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PARP3Q9Y6F1 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PARP3Q9Y6F1 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PARP3Q9Y6F1 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PARP3Q9Y6F1 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PARP3Q9Y6F1 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PARP3Q9Y6F1 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PARP3Q9Y6F1 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PARP3Q9Y6F1 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PARP3Q9Y6F1 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PARP3Q9Y6F1 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PARP3Q9Y6F1 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PARP3Q9Y6F1 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PARP3Q9Y6F1 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PARP3Q9Y6F1 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PARP3Q9Y6F1 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PARP3Q9Y6F1 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PARP3Q9Y6F1 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PARP3Q9Y6F1 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PARP3Q9Y6F1 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PARP3Q9Y6F1 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PARP3Q9Y6F1 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PARP3Q9Y6F1 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PARP3Q9Y6F1 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PARP3Q9Y6F1 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PARP3Q9Y6F1 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PARP3Q9Y6F1 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PARP3Q9Y6F1 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PARP3Q9Y6F1 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PARP3Q9Y6F1 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms