Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J5

PHLDA3, Pleckstrin homology-like domain family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDA3Q9Y5J5 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms