Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P4

RHBDD3, Rhomboid domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD3Q9Y3P4 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms