Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X0

MED16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, humanhuman

Predictions only

Length 877 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED16Q9Y2X0 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MED16Q9Y2X0 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MED16Q9Y2X0 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MED16Q9Y2X0 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MED16Q9Y2X0 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MED16Q9Y2X0 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MED16Q9Y2X0 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MED16Q9Y2X0 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MED16Q9Y2X0 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MED16Q9Y2X0 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MED16Q9Y2X0 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MED16Q9Y2X0 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MED16Q9Y2X0 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MED16Q9Y2X0 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MED16Q9Y2X0 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MED16Q9Y2X0 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MED16Q9Y2X0 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MED16Q9Y2X0 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MED16Q9Y2X0 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MED16Q9Y2X0 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MED16Q9Y2X0 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MED16Q9Y2X0 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MED16Q9Y2X0 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MED16Q9Y2X0 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MED16Q9Y2X0 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MED16Q9Y2X0 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MED16Q9Y2X0 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MED16Q9Y2X0 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MED16Q9Y2X0 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MED16Q9Y2X0 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MED16Q9Y2X0 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MED16Q9Y2X0 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MED16Q9Y2X0 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MED16Q9Y2X0 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MED16Q9Y2X0 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MED16Q9Y2X0 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MED16Q9Y2X0 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MED16Q9Y2X0 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MED16Q9Y2X0 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MED16Q9Y2X0 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MED16Q9Y2X0 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MED16Q9Y2X0 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MED16Q9Y2X0 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MED16Q9Y2X0 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MED16Q9Y2X0 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MED16Q9Y2X0 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MED16Q9Y2X0 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MED16Q9Y2X0 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MED16Q9Y2X0 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MED16Q9Y2X0 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MED16Q9Y2X0 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MED16Q9Y2X0 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MED16Q9Y2X0 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MED16Q9Y2X0 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MED16Q9Y2X0 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MED16Q9Y2X0 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MED16Q9Y2X0 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MED16Q9Y2X0 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MED16Q9Y2X0 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MED16Q9Y2X0 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MED16Q9Y2X0 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MED16Q9Y2X0 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MED16Q9Y2X0 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MED16Q9Y2X0 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MED16Q9Y2X0 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MED16Q9Y2X0 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MED16Q9Y2X0 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MED16Q9Y2X0 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MED16Q9Y2X0 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MED16Q9Y2X0 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MED16Q9Y2X0 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MED16Q9Y2X0 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MED16Q9Y2X0 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MED16Q9Y2X0 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MED16Q9Y2X0 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MED16Q9Y2X0 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MED16Q9Y2X0 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MED16Q9Y2X0 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MED16Q9Y2X0 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MED16Q9Y2X0 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MED16Q9Y2X0 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MED16Q9Y2X0 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MED16Q9Y2X0 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MED16Q9Y2X0 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MED16Q9Y2X0 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MED16Q9Y2X0 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MED16Q9Y2X0 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MED16Q9Y2X0 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MED16Q9Y2X0 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MED16Q9Y2X0 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MED16Q9Y2X0 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MED16Q9Y2X0 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MED16Q9Y2X0 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MED16Q9Y2X0 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MED16Q9Y2X0 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MED16Q9Y2X0 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms