Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms