Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE6

PALD1, Paladin, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALD1Q9ULE6 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PALD1Q9ULE6 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PALD1Q9ULE6 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PALD1Q9ULE6 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PALD1Q9ULE6 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PALD1Q9ULE6 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PALD1Q9ULE6 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PALD1Q9ULE6 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PALD1Q9ULE6 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PALD1Q9ULE6 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PALD1Q9ULE6 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PALD1Q9ULE6 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PALD1Q9ULE6 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PALD1Q9ULE6 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PALD1Q9ULE6 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PALD1Q9ULE6 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PALD1Q9ULE6 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PALD1Q9ULE6 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PALD1Q9ULE6 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PALD1Q9ULE6 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PALD1Q9ULE6 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PALD1Q9ULE6 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PALD1Q9ULE6 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PALD1Q9ULE6 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PALD1Q9ULE6 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PALD1Q9ULE6 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PALD1Q9ULE6 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PALD1Q9ULE6 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PALD1Q9ULE6 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PALD1Q9ULE6 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PALD1Q9ULE6 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PALD1Q9ULE6 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PALD1Q9ULE6 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PALD1Q9ULE6 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PALD1Q9ULE6 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PALD1Q9ULE6 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PALD1Q9ULE6 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PALD1Q9ULE6 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PALD1Q9ULE6 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PALD1Q9ULE6 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PALD1Q9ULE6 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PALD1Q9ULE6 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PALD1Q9ULE6 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PALD1Q9ULE6 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PALD1Q9ULE6 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PALD1Q9ULE6 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PALD1Q9ULE6 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PALD1Q9ULE6 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PALD1Q9ULE6 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PALD1Q9ULE6 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PALD1Q9ULE6 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PALD1Q9ULE6 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PALD1Q9ULE6 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PALD1Q9ULE6 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PALD1Q9ULE6 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PALD1Q9ULE6 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PALD1Q9ULE6 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PALD1Q9ULE6 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PALD1Q9ULE6 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PALD1Q9ULE6 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PALD1Q9ULE6 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PALD1Q9ULE6 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PALD1Q9ULE6 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PALD1Q9ULE6 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PALD1Q9ULE6 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PALD1Q9ULE6 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PALD1Q9ULE6 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PALD1Q9ULE6 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PALD1Q9ULE6 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms