Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRPF3Q9ULD4 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
BRPF3Q9ULD4 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
BRPF3Q9ULD4 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRPF3Q9ULD4 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRPF3Q9ULD4 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRPF3Q9ULD4 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRPF3Q9ULD4 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRPF3Q9ULD4 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRPF3Q9ULD4 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRPF3Q9ULD4 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRPF3Q9ULD4 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRPF3Q9ULD4 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRPF3Q9ULD4 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRPF3Q9ULD4 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRPF3Q9ULD4 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRPF3Q9ULD4 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRPF3Q9ULD4 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
BRPF3Q9ULD4 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRPF3Q9ULD4 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRPF3Q9ULD4 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRPF3Q9ULD4 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRPF3Q9ULD4 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRPF3Q9ULD4 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRPF3Q9ULD4 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRPF3Q9ULD4 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRPF3Q9ULD4 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRPF3Q9ULD4 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRPF3Q9ULD4 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRPF3Q9ULD4 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRPF3Q9ULD4 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRPF3Q9ULD4 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRPF3Q9ULD4 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRPF3Q9ULD4 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRPF3Q9ULD4 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRPF3Q9ULD4 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
BRPF3Q9ULD4 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRPF3Q9ULD4 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
BRPF3Q9ULD4 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRPF3Q9ULD4 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRPF3Q9ULD4 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRPF3Q9ULD4 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRPF3Q9ULD4 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
BRPF3Q9ULD4 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms