Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA2

FBXL4, F-box/LRR-repeat protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL4Q9UKA2 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms