Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK80

USP21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21Q9UK80 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP21Q9UK80 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
USP21Q9UK80 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
USP21Q9UK80 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
USP21Q9UK80 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP21Q9UK80 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP21Q9UK80 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP21Q9UK80 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP21Q9UK80 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms