Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms