Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms