Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBS0

RPS6KB2, Ribosomal protein S6 kinase beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB2Q9UBS0 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms