Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms