Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
CCDC180Q9P1Z9 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
CCDC180Q9P1Z9 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC37.26■■■■□ 3.56
CCDC180Q9P1Z9 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.56
CCDC180Q9P1Z9 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
CCDC180Q9P1Z9 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC37.26■■■■□ 3.56
CCDC180Q9P1Z9 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.56
CCDC180Q9P1Z9 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
CCDC180Q9P1Z9 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
CCDC180Q9P1Z9 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
CCDC180Q9P1Z9 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
CCDC180Q9P1Z9 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
CCDC180Q9P1Z9 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
CCDC180Q9P1Z9 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
CCDC180Q9P1Z9 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
CCDC180Q9P1Z9 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
CCDC180Q9P1Z9 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
CCDC180Q9P1Z9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
CCDC180Q9P1Z9 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
CCDC180Q9P1Z9 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
CCDC180Q9P1Z9 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC37.25■■■■□ 3.55
CCDC180Q9P1Z9 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC37.25■■■■□ 3.55
CCDC180Q9P1Z9 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
CCDC180Q9P1Z9 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
CCDC180Q9P1Z9 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
CCDC180Q9P1Z9 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
CCDC180Q9P1Z9 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
CCDC180Q9P1Z9 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
CCDC180Q9P1Z9 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
CCDC180Q9P1Z9 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
CCDC180Q9P1Z9 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
CCDC180Q9P1Z9 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC37.23■■■■□ 3.55
CCDC180Q9P1Z9 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC37.23■■■■□ 3.55
CCDC180Q9P1Z9 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC37.23■■■■□ 3.55
CCDC180Q9P1Z9 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
CCDC180Q9P1Z9 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
CCDC180Q9P1Z9 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.23■■■■□ 3.55
CCDC180Q9P1Z9 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC37.23■■■■□ 3.55
CCDC180Q9P1Z9 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
CCDC180Q9P1Z9 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
CCDC180Q9P1Z9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
CCDC180Q9P1Z9 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
CCDC180Q9P1Z9 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
CCDC180Q9P1Z9 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
CCDC180Q9P1Z9 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
CCDC180Q9P1Z9 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
CCDC180Q9P1Z9 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC37.22■■■■□ 3.55
CCDC180Q9P1Z9 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
CCDC180Q9P1Z9 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
CCDC180Q9P1Z9 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
CCDC180Q9P1Z9 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
CCDC180Q9P1Z9 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
CCDC180Q9P1Z9 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
CCDC180Q9P1Z9 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
CCDC180Q9P1Z9 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
CCDC180Q9P1Z9 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
CCDC180Q9P1Z9 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
CCDC180Q9P1Z9 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
CCDC180Q9P1Z9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
CCDC180Q9P1Z9 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
CCDC180Q9P1Z9 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
CCDC180Q9P1Z9 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC37.21■■■■□ 3.55
CCDC180Q9P1Z9 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC37.21■■■■□ 3.55
CCDC180Q9P1Z9 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
CCDC180Q9P1Z9 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
CCDC180Q9P1Z9 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
CCDC180Q9P1Z9 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
CCDC180Q9P1Z9 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
CCDC180Q9P1Z9 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
CCDC180Q9P1Z9 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC37.21■■■■□ 3.55
CCDC180Q9P1Z9 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC37.21■■■■□ 3.55
CCDC180Q9P1Z9 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC37.21■■■■□ 3.55
CCDC180Q9P1Z9 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
CCDC180Q9P1Z9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
CCDC180Q9P1Z9 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
CCDC180Q9P1Z9 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
CCDC180Q9P1Z9 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
CCDC180Q9P1Z9 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
CCDC180Q9P1Z9 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
CCDC180Q9P1Z9 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
CCDC180Q9P1Z9 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
CCDC180Q9P1Z9 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
CCDC180Q9P1Z9 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
CCDC180Q9P1Z9 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
CCDC180Q9P1Z9 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
CCDC180Q9P1Z9 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
CCDC180Q9P1Z9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
CCDC180Q9P1Z9 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
CCDC180Q9P1Z9 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
CCDC180Q9P1Z9 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC37.19■■■■□ 3.54
CCDC180Q9P1Z9 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
CCDC180Q9P1Z9 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.19■■■■□ 3.54
CCDC180Q9P1Z9 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
CCDC180Q9P1Z9 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
CCDC180Q9P1Z9 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
CCDC180Q9P1Z9 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC37.18■■■■□ 3.54
CCDC180Q9P1Z9 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
CCDC180Q9P1Z9 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
CCDC180Q9P1Z9 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
CCDC180Q9P1Z9 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC37.18■■■■□ 3.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms