Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms