Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI2

KCNIP1, Kv channel-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP1Q9NZI2 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms