Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms