Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms