Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms