Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMPRSS4Q9NRS4 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMPRSS4Q9NRS4 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMPRSS4Q9NRS4 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMPRSS4Q9NRS4 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMPRSS4Q9NRS4 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TMPRSS4Q9NRS4 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMPRSS4Q9NRS4 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMPRSS4Q9NRS4 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMPRSS4Q9NRS4 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMPRSS4Q9NRS4 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMPRSS4Q9NRS4 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMPRSS4Q9NRS4 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMPRSS4Q9NRS4 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMPRSS4Q9NRS4 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMPRSS4Q9NRS4 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMPRSS4Q9NRS4 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMPRSS4Q9NRS4 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMPRSS4Q9NRS4 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMPRSS4Q9NRS4 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMPRSS4Q9NRS4 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMPRSS4Q9NRS4 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMPRSS4Q9NRS4 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMPRSS4Q9NRS4 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMPRSS4Q9NRS4 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMPRSS4Q9NRS4 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMPRSS4Q9NRS4 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMPRSS4Q9NRS4 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMPRSS4Q9NRS4 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMPRSS4Q9NRS4 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMPRSS4Q9NRS4 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMPRSS4Q9NRS4 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMPRSS4Q9NRS4 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TMPRSS4Q9NRS4 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMPRSS4Q9NRS4 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMPRSS4Q9NRS4 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMPRSS4Q9NRS4 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TMPRSS4Q9NRS4 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMPRSS4Q9NRS4 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMPRSS4Q9NRS4 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMPRSS4Q9NRS4 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMPRSS4Q9NRS4 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMPRSS4Q9NRS4 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMPRSS4Q9NRS4 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMPRSS4Q9NRS4 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMPRSS4Q9NRS4 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMPRSS4Q9NRS4 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMPRSS4Q9NRS4 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMPRSS4Q9NRS4 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMPRSS4Q9NRS4 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TMPRSS4Q9NRS4 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMPRSS4Q9NRS4 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMPRSS4Q9NRS4 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMPRSS4Q9NRS4 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TMPRSS4Q9NRS4 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMPRSS4Q9NRS4 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TMPRSS4Q9NRS4 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMPRSS4Q9NRS4 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TMPRSS4Q9NRS4 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMPRSS4Q9NRS4 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMPRSS4Q9NRS4 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMPRSS4Q9NRS4 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TMPRSS4Q9NRS4 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMPRSS4Q9NRS4 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TMPRSS4Q9NRS4 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMPRSS4Q9NRS4 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMPRSS4Q9NRS4 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TMPRSS4Q9NRS4 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TMPRSS4Q9NRS4 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TMPRSS4Q9NRS4 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMPRSS4Q9NRS4 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMPRSS4Q9NRS4 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMPRSS4Q9NRS4 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMPRSS4Q9NRS4 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMPRSS4Q9NRS4 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMPRSS4Q9NRS4 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMPRSS4Q9NRS4 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMPRSS4Q9NRS4 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMPRSS4Q9NRS4 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMPRSS4Q9NRS4 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMPRSS4Q9NRS4 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMPRSS4Q9NRS4 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMPRSS4Q9NRS4 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMPRSS4Q9NRS4 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TMPRSS4Q9NRS4 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMPRSS4Q9NRS4 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMPRSS4Q9NRS4 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMPRSS4Q9NRS4 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMPRSS4Q9NRS4 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMPRSS4Q9NRS4 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMPRSS4Q9NRS4 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMPRSS4Q9NRS4 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMPRSS4Q9NRS4 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMPRSS4Q9NRS4 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMPRSS4Q9NRS4 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMPRSS4Q9NRS4 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMPRSS4Q9NRS4 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMPRSS4Q9NRS4 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms