Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHST12Q9NRB3 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms