Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
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LHX9Q9NQ69 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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