Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms