Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB18Q9NP72 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms